余牙兵被全部打散编制，拆分编入各营，派天启军老兵层层监督，不单独成军。
连重遇名义上仍保留统管之衔，但军械统一收缴入库、按需申领，实际调兵之权已归翟进宗一人之手。
裁汰老弱，精简后转为辅兵，负责巡街、修缮城防、转运物资，不重甲与兵器。
天启军驻守东门、水部门、闽江码头三大要害，控扼入城与对外联络命脉。
降军分守其余城门与外郭。
当众重申军纪。
严禁劫掠、扰民、私斗、擅离驻地，军法一体对待新旧各部，有功同赏、犯错同罚。
粮政方面，水丘昭券亲自坐镇。
他下令打开官仓与朱文进私库，按人口分发米粮，优先赈济老弱、妇孺、饥民。
放粮在城中几处坊市同时进行，水丘昭券站在粮堆后面，看着那些面黄肌瘦的百姓捧着米袋嚎啕大哭。
同时严管粮市，派兵进驻米铺核实存粮、限定售价，打击囤积居奇的奸商。
两个哄抬米价的商户当天便被封了铺面，抄出私藏的存粮全部充入官仓。
然后卫融以文告形式通告全城。
彻底废除王氏、朱文进时期的杂项税目。
蔬果、柴薪、家禽、入市税等一律取消。
暂停征发民丁，休养生息。
文告张贴在各坊门口，识字的老儒生念给围观的百姓听。
念到免除一切杂税时，人群中爆发出的欢呼声连卫融在府衙都能听见。
城市修复同步展开。
抽调辅兵，征募民夫，按日结算工钱。
清理街巷瓦砾与路边荒尸，集中掩埋，防止瘟疫扩散。
修补坍塌城墙，堵塞缺口，疏通淤塞的护城河。
开放城外空宅与官舍安置流民，劝导百姓返乡耕种。
大部分文武官员照旧留任，维持政务运转。
但核心职位全部换上天启军将校或联军文职。
城守、钱粮、刑狱、驿传四大要害尽在掌控。
对连重遇加封虚衔，表面礼遇有加，凡事与之商议，给予体面。
但不授予调兵、掌粮、驻外之权，将其束缚在福州城内。
利用他在军中的威望安抚旧部，同时暗中派人监视。
清查官吏过往劣迹，贪腐酷吏降职贬斥，清廉务实者予以嘉奖。
安民告示贴遍全城，申明出兵本意。
应昔日求援之约，平定闽国内乱
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