合理的赋税制度，减免战乱地区百姓的赋税，鼓励农耕生产；同时，在中原各地设立州县官府，任用儒士、贤才为官，废除苛捐杂税，整肃贪官污吏，让中原百姓得以休养生息。
他还保护天下典籍，派人收集战乱中散落的儒家、佛家、道家典籍，送往漠北与中都，设立书院，让儒士讲学，结束了蒙古帝国无文治、轻文教的历史。同时，他还向成吉思汗进言，重用汉臣、契丹臣、女真臣，不分民族，唯才是举，让蒙古帝国渐渐成为兼容多民族、多文化的庞大帝国。
成吉思汗对耶律楚材愈发信任，凡事皆与他商议，无论是南征伐金，还是日后谋划西征，都会听取他的谏言，减少屠戮，安抚降民。耶律楚材也始终坚守初心，以安民济世为己任，多次冒死进谏，阻止成吉思汗的杀伐之举，救下无数百姓性命。
有一次，蒙古大军攻打河东一座小城，守军顽强抵抗，城破之后，诸将请求屠城，以儆效尤。成吉思汗已然应允，耶律楚材得知后，连夜闯入金帐，跪地叩首，苦苦劝谏：“大汗，万万不可屠城！城中百姓，皆是无辜，守军抵抗，乃是各为其主，百姓何罪？屠城只会失了民心，让天下城池皆拼死抵抗，得不偿失啊！”
成吉思汗看着跪地苦谏的耶律楚材，心中动容，最终收回成命，下令禁止屠戮，安抚城中百姓。全城百姓得知，无不感恩耶律楚材的活命之恩，中原百姓对蒙古政权的抵触，彻底消解。
耶律楚材以一介文臣，辅佐成吉思汗，改变了蒙古帝国的统治策略，让蒙古从单纯的武力征服，转向文治武功并举，止杀安民，安抚天下，为蒙古帝国的稳固与扩张，奠定了坚实的文治基础。
漠北草原的金帐之中，成吉思汗看着案头日渐充盈的赋税账簿，看着中原百姓安居乐业的奏报，看着耶律楚材伏案理政的身影，笑着对诸子道：“耶律先生，乃是上天赐给我蒙古的奇才，有他在，朕的江山，必能长治久安，征服四海的大业，必能成功！”