很久以前，五号堡是一座军事科研基地。
原久之前的冷战时期，这片区域的地下被挖空，建成了一个庞大的地下建筑群。地上部分是伪装——几栋不起眼的仓库、一座小型发电站、一排士兵宿舍。地下部分才是真正的核心，有实验区、培养区、动物房、冷库、焚烧炉，还有一套独立的核能供电系统。走廊四米宽，天花板三米高，墙壁是六十厘米厚的钢筋混凝土，表面涂着银灰色的防辐射涂料。通风管道里永远有风在吹，恒温恒湿，二十摄氏度，百分之五十的湿度。
军方在这里研究生物武器、神经毒剂、基因编辑技术，项目代号和具体内容随着核弹的落下一起被埋进了废墟。
核战后，这片区域被辐射尘覆盖了将近三十年。等到辐射水平降到人能进入的程度，已经是新历十年以后的事了。联合政府派人来勘察，发现地下的实验室大部分还完好，通风系统、供水系统、备用电源都在运转，那套核能供电装置甚至还能再撑二百年。于是决定把这里改造成一下，继续科研，用来研究新世界的科技和核战后出现的变异生物。
新历三十年，五号堡正式启用。
改造工程由政府科技部主导，具体执行者是五号堡的第一任负责人，一个叫山本一郎的科学家。山本在核战前就是生物武器领域的研究员，战后被收编，成了联合政府的科研骨干。他按照要求，在五号堡原有的基础上增加了新的实验设备、生物样本库、武器研发中心，还建立了一套完整的自动化防御系统。
防御系统的核心是一台军用计算机，连接着地下各个区域的传感器、摄像头、电磁脉冲发生器和毒气释放装置。毒气系统是山本研从政府军火库里翻出来的——一种代号为“VX-7”的神经毒气，无色无味，通过通风管道释放，吸入后三十秒内会导致呼吸肌麻痹，两分钟内死亡。这种毒气在旧世界时期就被国际公约禁止使用，但在末日之后，没有人会在意了。
山本在五号堡的每个通风管道接口处都安装了毒气释放装置，一共四十七个，覆盖了地下所有区域。如果有人从地面强行进入，防御系统会按照预设的程序自动反击——先释放VX-7神经毒气，再用隐藏的自动武器扫射，最后启动电磁脉冲摧
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