工匠仿照城墙马面结构，在沙漠边缘筑起“品字形阻沙墩”，墩间以绳索串联草帘，风沙来时层层缓冲。“这法子虽笨，却比空谈天道管用。”他在给皇帝的密折中写道。
当民间出现“流沙钟”预警装置——竹筒内装细沙，沙流速度异常时便触发铃铛——朝堂却吵作一团。保守派御史弹劾：“以机巧惑众，必乱人心！”但首辅申时行指着边疆捷报反驳：“自设流沙钟，百姓提前避灾，死伤减少七成！”朱翊钧最终御批：“有用者留，无用者废，勿做书生空谈。”这场争论后，连后宫嫔妃都开始用治沙节省的经费，资助民间发明治沙新器械。