全人类为之振奋，被视为解决资源危机的希望之光。
随后数年，同级别的裂解舰相继建成服役。
然而有限的采矿舰队根本无法满足人类文明日益膨胀的资源需求。
为了维系地球联邦这个庞然大物的正常运转
一群激进科学家开始研究从远古陨石坑中发掘出的神秘造物“神印”，经过数百年的秘密实验，他们宣称从中发现了获取无限能源的可能。
但无人察觉，这份“天赐厚礼”实则是悬在人类头顶的达摩克利斯之剑。
这个来自深空的诡异造物持续不断地向外辐射着能够扭曲人类心智的特殊电磁波。
当这种精神污染积累到临界值时，就会引发人类DNA/RNA的结构性异变，将感染者转化为恐怖的尸变体。
通过某种未知的聚合机制，这些怪物最终会融合成吞噬万物的“血月”。
部分被神印彻底洗脑的人类成为了狂热的信徒，他们组建地下教会（因审核原因省略具体名称），暗中发展势力。
这些极端分子坚信神印是推动人类进化的神圣媒介。
他们将人类现有的生理形态、痛苦与死亡，视为需要革除的缺陷。
鼓吹通过集体升维和意识融合来实现所谓的“终极进化”。
为此，他们不惜与联合政府公开对抗，在各殖民地策动骚乱，同时秘密复制大量神印以获取能源。
当石村号事件与泰坦空间站惨案接连爆发后
潜伏在政府内部的教会势力趁机发难，经过三年的精心运作，已完全掌握战略主动权。
星历2577年
教会正密谋对摇摇欲坠的联合政府发动致命一击，企图夺取地球控制权。
与此同时
亲历过石村号与泰坦空间站双重噩梦的“艾萨克·克拉克”，却收到了一封特殊的求救信。
来信者是他的前女友艾莉，恳求他协助摧毁神印。
但饱经创伤的艾萨克已意志消沉，蜗居在月球殖民地拒绝了这一请求。
至此，《死亡空间3》的剧情由此展开。
一方面，联合政府在教会攻势下节节败退，大量复制神印被激活，全球范围内的尸变体感染已完全失控。
就连月球殖民地也在教会的攻击下沦陷。
另一方面，政府军指挥官诺顿与中士拉沃尔前来寻找艾萨克，请求艾萨克的帮
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