大约用了将近两年的时间，全国各地算是整顿完毕了。对于全国各地的整顿，朱慈琅是抱有很强的信心的，而且在执行力方面也不允许有任何人阻止。
一旦要是有人唱反调的话，不管你是站在哪个角度上，也不管你是因为什么样的原因，一律都先把你撤职查办。就算是你现在提的要求是正确的，但如果要是阻挠了我们的改革，那也是绝对不行的。
朱慈琅知道有些事情不能够让下面这些人乱参与，有的事情是可以提意见的，但有的事情必须得先执行才能提意见。就拿军事和政治改革来说，这就是整个大明朝奠基的基础。一旦要是没办法全国改革完毕的话，那么那些特殊地区很有可能会扩大，对于整个朝廷来说是没有什么好处的。
所以不管全国各地发生了什么样的情况，哪怕是你当地抗拒改革，已经有了军事政变的行为，朱慈琅也必须得让改革完成才行。只有让改革完成，才能够把旧的体制给铲除，这对于现如今的大明朝来说，优先于其他所有的任务。
刚开始的时候，那些旧的势力门阀还想着能够阻挠一下，看看是不是能够为他们谋取一些利益。但是过了一段时间之后，这些人也算是看出来了，朱慈琅是不会给他们这个机会的。如果你们要想在这件事情上乱来的话，那恐怕你们这日子过得不是那么好。而且我们在做这样的事情的时候，也绝不会让你们这些人继续留在原来的位置上。
久而久之的，这帮人也算是看清楚了。如果要是在这种情况下继续阻拦的话，对大家来说也没有什么好处。而且在阻拦的过程当中，很有可能会把祖宗基业都给丢了。所以这些人经过一阵权衡利弊之后，也开始放弃手中的权力，迎合朝廷的改革。
用两年的时间让整个大明阵痛一下，然后换来一个新的大明，这对朱慈琅来说是完全没有问题的。两年过后，大明帝国开始了新的征战。朱慈琅命令驻扎在扶桑的军队，对整个扶桑列岛开战。之前的时候只是占领了他们一个岛屿而已，现在时机已经成熟了，也让我们大明的军队到战场上去施展一下。
扶桑朝廷从来没有想过能够苟延残喘，从他们签署了不平等协议开始，他们就暗地里开始积蓄力量，想着有一天
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