次才是对现有军队的模式进行改制，提出现在的兵部已经不适应当今世界复杂的战争形式，兵部的所有官员，要么离开，要么纳入军队体系。而改制后的兵部，应该是一个由皇帝直属的军队，内阁对兵部没有管辖权，只有监督的权利。
兵部（可以看做总参谋部），下设，陆军部，海军部。陆军下设军区，海军下设各大舰队。
具体到选拔机制，贾琏强调了必须是皇家军校毕业生优先。
弄了一个提纲之后，贾琏进宫见李元当面上呈。
李元看罢，很认真的请教：“本朝自问待武勋不薄，为何还要提高军人地位，还请先生解惑。”
贾琏很耐心的解释：“决定军队战斗力的不仅仅是高层，更多的还是靠基层官兵奋勇。世人以从军为耻，军人未战先弱。微臣想要打造的军队，不仅仅是战时作战的武装力量，太平年间，还应该是抢险救灾的子弟兵。”
能不能做到不说，肯定是要朝那个方向努力的，总不能跟过去一样，匪过如梳，兵过如篦。
李元继续往下看，看到连以上要设德化官时，更是错愕道：“这个德化官，怎么个说法？”
贾琏继续耐心解释：“德化官，主抓军队日常生活，教育他们忠君爱国，教育他们要知道礼义廉耻，要有军人的荣誉感。教育之外，还要关心士兵的生活，督促军纪的执行。微臣以为，新的军制中必须有一条禁令，禁止军官打骂士兵。这一条没详细展开说，是希望陛下来提。”
李元顿时眼睛一亮，默默的点点头，继续看关于兵部的改革。设陆军、海军、后勤、装备、宪兵等部门。每个部门都要设相应的监督机制。
认真的看完之后，李元内心颇为震撼，如此一来，整个旧军制被彻底的颠覆了。从皇帝的视角看这次军改，无疑更方便皇帝掌握军队权利。
“卿的意思，朕来拟提纲，交由兵部完善，最后全军推广？”李元多少有点疑问的，毕竟贾琏是首辅，他不该背叛文官集团。
贾琏淡淡道：“陛下，微臣就是这个意思，应该是兵部牵头，军校配合，军中抽调有欧洲军事考察经验的军官参与完善军改内容。”
李元不禁好奇道：“以卿的意思，欧洲军队建设有值得借鉴和学习的优点？”
贾琏道
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